До ХVII в. в Кремле, как и вообще в России, не ставилась задача сохранения древних сооружений. Древность, как таковая, не представляла ценности. Обветшавшие здания разрушались и на их месте возводились новые, соответствующие вкусам и запросам эпохи

В 2006 году Музеи Московского Кремля будут праздновать свой 200-летний юбилей. Датой основания музея принято считать 10 марта 1806 года. В этот день император Александр I подписал указ О правилах управления и сохранения в порядке и целости находящихся в Мастерской и Оружейной палате ценностей , который завершил начатый еще Петром I процесс преобразования царских хранилищ и мастерских в музей. Оружейная палата стала первым в Москве общедоступным музеем, деятельность которого вписала значимую страницу в историю музейного дела всей России

Социально - экономические перемены, произошедшие в России в последнее десятилетие ХХ века, привели к необходимости внесения ряда существенных изменений в систему управления музеем и в его статус.

Во исполнение Указа Президента Российской Федерации от 7 апреля 2001 г. разрабатывается и Постановлением Правительства от 19 июля 2001 г. утверждается “Устав федерального государственного учреждения “Государственный историко-культурный музей-заповедник “Московский Кремль”

На основании Постановления ЦК КПСС и Совета Министров СССР от 5 февраля 1960 года Оружейная палата и соборы Кремля изымались из состава Комендатуры и создавалось новое учреждение - Государственные музеи Московского Кремля в ведении Министерства Культуры СССР. 9 апреля 1960 года был подписан Акт о передаче зданий и имущества из Комендатуры на баланс музея.

В начале 1947 года музей вновь теряет свою административную самостоятельность. Оружейная палата и музеи-соборы под названием Отдел сохранения исторических ценностей и памятников Московского Кремля становятся одним из структурных подразделений Комендатуры Московского Кремля.